Table 2 Summary of potential transcription factors in each GAF rank
GAF ranks | TFs | MEME | TOMTOM | |
|---|---|---|---|---|
E values | p values | q values | ||
GAF-I | SR | 3.6 × 10−12 | 5.9 × 10−6 | 4.8 × 10−3 |
KLU | 7.2 × 10−6 | 5.8 × 10−3 | ||
FRU | 1.2 × 10−5 | 9.4 × 10−3 | ||
RN | 4.1 × 10−5 | 3.3 × 10−2 | ||
GAF-II | JIM | 3 × 10−32 | 3.4 × 10−7 | 2.7 × 10−4 |
RN | 4.2 × 10−5 | 3.4 × 10−2 | ||
JIGR1 | 4.9 × 10−5 | 4 × 10−2 | ||
GAF-III | GAF | 5.2 × 10−37 | 3.3 × 10−6 | 2.7 × 10−3 |
JIM | 2.3 × 10−19 | 2.1 × 10−6 | 1.7 × 10−3 | |
JIGR1 | 1.4 × 10−5 | 1.1 × 10−2 | ||
RN | 5 × 10−5 | 4 × 10−2 | ||
GAF-IV | GAF | 6.3 × 10−103 | 2.2 × 10−6 | 1.8 × 10−3 |
BAB1 | 2.6 × 10−21 | 6.5 × 10−5 | 5.3 × 10−2 | |
MAD | 1.5 × 10−10 | 1.3 × 10−5 | 1.1 × 10−2 | |
JIM | 1.2 × 10−4 | 6.5 × 10−6 | 5.3 × 10−3 | |
RN | 5.6 × 10−5 | 4.5 × 10−2 | ||